Les projets de recherche de l'HEMU s'inscrivent dans cinq axes:

1) pédagogie: enseignement musical sous toutes ses formes, individuel et collectif, professionnel et non-professionnel; transfert des savoirs; modalités de formation des professeurs; variété et spécificité des apprenants;

2) interprétation: pratiques instrumentales et vocales dans leurs dimensions actuelles et historiques; questionnement des traditions, tant occidentales que non-occidentales;

3) création: outils, techniques, structures et formes d'expression à disposition des créateurs; perception et réception des œuvres; frontières et interactions entre différentes facettes de la création;

4) métier: conditions socioprofessionnelles, insertion professionnelle; relation des artistes avec leur public et avec la société, politiques culturelles, actions de médiation; aspects psychologiques et physiologiques du métier;

5) arts et sciences: projets au croisement des disciplines artistiques, scientifiques et technologiques.